Det trefarvet egern bosætter sig i hule træer, eller laver reder af kviste og blade. Dette egern spiller en vigtig rolle i dens økosystem, i forhold til at sprede plantefrø. De tager frugter fra træer og æder frugtkødet, men æder ikke altid frøene indeni, som de i stedet smider på jorden. På den måde kommer frøene længere væk fra de træer, de vokser på, end de gjorde, hvis de endte i nedfaldsfrugt.
På grund af de flotte sorte, hvide og røde aftegninger, bliver det trefarvet egern af nogle anset som værende det mest farverige pattedyr.